董福祥收复南北疆，率兵杀敌，屡立战功，得慈禧赏识

董福祥直取南疆，杀敌甚重，收复南北疆，并屡歼入侵之敌
光绪元年（1875年），左宗棠率大军以刘锦堂为先导，“董字三营”为主力，西征新疆，反击阿古柏侵略势力。“董字三营”系西北土生土长的部队，不惧风沙，冲锋在前，大破天山木里河、古牧地后，一举收复乌鲁木齐，攻克玛纳斯城，首战告捷。

董福祥在新疆驻守19年，御敌戍边，兴修水利，开垦屯田，整修道路，政绩卓著，赢得朝野赞誉。

董福祥得慈禧赏识，率兵剿匪，屡立战功，复任甘肃提督
光绪二十年（1894年），中日甲午战争爆发，董福祥晋尚书衔，奉旨率甘军入卫京师，屯驻蓟州一带，受到慈禧的接见和赏识。
光绪二十一年（1895年），甘肃河州、湟中等地又爆发回族和撒拉族的农民起义，董福祥被任命为甘肃提督，率部进剿，平定匪乱后加封为太子少保，赏赐骑都尉世职。
光绪二十三年（1897年），董福祥奉命率甘军进京。戊戌政变后，董军被编入武卫军，成为北洋三军之一。董福祥任武卫军统领，驻防直隶、山西。
光绪二十五年（1899年），董福祥复任甘肃提督。